Sur les 40 km de l'opération, de nombreuses espèces emblématiques protégées au niveau national voire européen ont en effet été recensées et font l’objet de mesures particulières : l'Agrion de Mercure, le Lézard Ocellé, la Pie grièche à tête rousse...
L’objectif dans la démarche « Éviter, Réduire, Compenser » est de concevoir le projet avec le moindre impact pour l’environnement en :
- donnant la priorité aux mesures d’évitement, puis de réduction de l’impact,
- définissant si nécessaire, des mesures de compensation de cet impact,
- pérennisant les effets des mesures de réduction et de compensation aussi longtemps que les effets sont présents.